To af de naturhistorisk absolut største attraktioner i Bøtø området, er de to dagsommerfugle: Sort ildfugl og spejlbredpande. Det er det eneste sted i Danmark, hvor den sorte ildfugl findes. Det varme tørre klima i området betyder i det hele taget, at Bøtø er en enestående sommerfuglelokalitet. Omkring 40 forskellige dagsommerfugle er kendt fra området, men også flere hundrede forskellige arter af natsommerfugle, heriblandt nogle der er meget sjældne. Sommeren er den gode tid, hvis man vil se på sommerfugle. Mange af arterne har en meget kort sæson, de er måske kun aktive en måned eller to, så hvis man kommer for sent, må man tage turen igen til næste år. 

Husk at sommerfuglene er sarte væsner, så hvis du fanger en, skal den håndteres forsigtigt, inden du sætter den fri igen.